| JohnsHopkinsHospital創立於1890年,是個有百年歷史的醫院,同時也連續十六年被評為全美第一的醫院,JohnsHopkinsHospitalPancreaticCancerEarlyDetectionLaboratory更是全美也是全球頂尖的胰臟癌研究中心,享有卓越聲譽。職的PreceptorDr.MichaelGoggins是DirectorofthePancreaticCancerEarlyDetectionLaboratory。隨著人類壽命的延長,胰臟癌成為全世界癌症死因的前幾名,且其發生率還在上升中。胰臟癌的致死率比其他癌症為高,了解胰臟癌的致病機轉及早期偵測胰臟癌是非常重要的。以往,研究者重心皆放在胰臟癌的geneticchanges；近年來,epigenetics被發現是胰臟癌生成主要且重要的機轉之一。約一半的人類基因有5-CpGislands,這些CpGislands與基因5-端控制區有密切關係。正常細胞大部分基因的5-CpGislands都是未甲基化,但在腫瘤生成時變成甲基化。甲基化的5-CpGislands經由與甲基化CpG結合蛋白(methylCpGbindingproteins)、histones及histonedeacetylases,造成chromatin的變化,導致transcriptionalsilencing。Promoter甲基化在許多癌症的tumorsuppressorgenes及mismatchrepairgenes的transcriptionalsilencing扮演重要的角色。在本研究中,我們使用methylatedCpGislandamplification(MCA)配合proximalpromotermicroarray來偵測人類胰臟癌細胞株PL-3及mixednormalcontrols不同甲基化的CpGislands。我們接著運用expressionmicroarray來偵測有transcriptionalsilencing的基因,且這些silencing可以被5-aza-2--deoxycytidine處理後復原。我們選擇那些在MCA-proximalpromotermicroarray及expressionmicroarray都有相對於控制組有4倍訊號升高的基因。發現DLL1、DLC1、TCF12、CDCP1、WNT5A、RNF144及SHH符合收錄標準；接著我們以methylation-specificPCR(MSP)及bisulfitesequencingPCR檢驗胰臟癌細胞株上述基因的甲基化情況,初步結果顯示WNT5A及SHH在PANC-1transcriptionstartsite附近的promoterregion及CCCGGG完全甲基化,而在HPDE完全未甲基化。另外,我們以NPTX2、RELN、DAB1、RPRM、TFPI2、SARP2MSP偵測pancreaticductbrushsamples的甲基化情形,發現可以幫助鑑別診斷良性或惡性疾病。 |